Choisir le professeur principal est de la compétence du chef d'établissement. Le professeur principal exerce le rôle de coordinateur et assure le suivi et l'aide des élèves, le bilan de leur scolarité.

On ne peut, pas plus qu'aux autres enseignants, lui imposer des tâches outrepassant ses missions (études dirigées, tutorat, enseignement hors discipline, PPCP, PFE, modules, heure de vie de classe, etc.).

L'heure de vie de classe est un temps de dialogue entre les élèves, entre les élèves et un ou des membres de l'équipe éducative, ou avec des intervenants extérieurs. Il existe un flou sur les conditions de la rémunération de ceux qui l'organisent. A l'heure actuelle, cette heure est le plus souvent imposée au professeur principal, alors même qu'elle ne lui incombe pas nécessairement et n'est pas comprise dans l'ISOE. En tout état de cause, lorsqu'il contribue à l'organiser, il doit, comme les autres intervenants, être rémunéré et refuser toute forme de bénévolat.